De Ninja 5 bevat twee Kaze Flex 120 PWM ventilatoren die stil zijn zonder afbreuk te doen aan de hoge prestaties die van de Ninja-serie wordt verwacht. De twee ventilatoren zijn gemonteerd volgens het Push/Push principe en de ventilator snelheid is ingesteld op slechts 800 rpm. De bekroonde Kaze Flex ventilatoren gebruiken Sealed Precision Fluid Dynamic Bearings voor een lange levensduur van 120.000 uur (MTTF). De heatsink is ontworpen voor een hoge compatibiliteit en ondersteunt zelfs LGA 2066 moederborden met acht RAM-slots. Zes vernikkelde 6 millimeter koperen heatpipes, een vernikkelde koperen basisplaat en de zwarte geanodiseerde bovenplaat onderstrepen de hoge kwaliteit afwerking. Daarnaast wordt het Hyper Precision Mounting System (H.P.M.S.) gebruikt, wat de montage aanzienlijk vereenvoudigt en compatibiliteit biedt met verschillende AMD en Intel sockets.
